Dalam hal ini, NU harus memastikan bahwa kerja sama dengan pemerintah tidak akan mengorbankan independensi yang dimiliki. Sehingga apa yang diharapkan Gus Dur tentang peran agama dalam kehidupan bernegara, tetap menjadi kekuatan yang aktif dan kritis dalam mengawasi dan memberikan kontribusi pada pengembangan negara, dan tidak menjadi organisasi yang hanya mempertahankan kepentingan pemerintah.
Oleh karena itu, NU harus memperhatikan beberapa prinsip yang dapat diambil dari pesan Gus Dur, seperti halnya; kritis, peduli, mandiri, dan bijaksana. Dengan memperhatikan prinsip-prinsip itulah, saya pikir, NU dapat memastikan bahwa harapan Gus Dur tentang peran agama dalam kehidupan bernegara dapat diwujudkan dengan baik. Artinya tidak kehilangan independensi yang harus dipegang seutuhnya.
Oleh karena itu, berhubungan baik, tapi tetap menjaga sikap kritis itulah yang menjadi landasan bagi demokrasi negara kita. Maka tak heran, jika Gus Dur menyampaikan, bahwa yang lebih penting dari politik adalah kemanusiaan.