Salah satu alasan yang mendukung kehadiran santri online adalah bahwa hal tersebut membantu mempertahankan pesantren tradisional.
Kini, teknologi memungkinkan pesantren menjangkau lebih banyak santri potensial di Indonesia dan bahkan di luar negeri sehingga memperkuat posisi mereka sebagai pusat pendidikan agama yang relevan dan dinamis di era digital ini.
Di sisi lain, kontroversi muncul tentang komersialisasi pendidikan online. Ada kekhawatiran bahwa, seiring dengan popularitasnya, penggunaan teknologi dapat mengarah pada motivasi ekonomi yang mengaburkan tujuan utama pendidikan agama.
Beberapa platform pendidikan online mungkin lebih fokus pada keuntungan finansial dan popularitas daripada kualitas dan kedalaman pengajaran agama. Hal ini dapat menyebabkan distorsi nilai-nilai pendidikan agama, di mana kualitas pengajaran dan kedalaman ilmu agama mungkin tidak menjadi prioritas utama.
Selain itu, ada juga kekhawatiran tentang bagaimana santri online akan berdampak sosial pada pesantren tradisional. Karena semakin banyak santri beralih ke platform online, pesantren yang bergantung pada pendanaan dan kontribusi santri konvensional mungkin merasa terancam eksistensinya. Hal ini dapat menyebabkan penurunan jumlah santri di pesantren tradisional, yang pada gilirannya dapat mempengaruhi keberlanjutan dan keberagaman pesantren sebagai lembaga pendidikan agama yang sangat penting dalam budaya dan tradisi Indonesia.