Sejak awal, Al-Karimiyah memasukan sistem pendidikan salaf dengan modern. Karena itu, kini ratusan santrinya ada bersekolah di Madrasah Ibtidaiyah Al-Karimiyah, Madrasah Tsanawiyah Al-Karimiyah, dan Madrasah Aliyah Al-Karimiyah.
Bahkan, di pesantren yang berlokasi di bilangan Sawangan ini sudah ada perguruan tingginya, Institut Agama Islam Depok (IAID) Al-Karimiyah. Sebelumnya, perguruan tinggi ini bernama Sekolah Tinggi Agama Islam Al-Karimiyah (STAISKA). Namun, sejak Desember 2022 STAISKA menjadi IAID, dan menjadi yang pertama di Kota Depok.

Dengan berbagai pengembangan lembaga pendidikannya tersebut, Pesantren Al-Karimiyah ingin memperkuat peran santri dalam menyongsong Indonesia Emas 2045.
