Senin, 16 Mei 2022, KH Miftahul Arifin Zain, yang biasa disapa Kiai Miftah telah wafat. Informasi yang beredar di berbagai media sosial ini menimbulkan duka yang begitu mendalam bagi santri, alumni, dan masyarakat di sekitar Pesantren Al-Munawarah. Lembaga pendidikan pesantren yang membawahi RA, MI, dan MA ini berlokasi di Desa Batuputih Kenek, Batuputih, Sumenep, Jawa Timur.
Berita wafatnya Kiai Miftah yang viral dan dikirim berantai di grup WA mengejutkan sebagian orang. Karena selama ini tidak ada kabar berita kalau Kiai yang masih muda ini dalam keadaan sakit. Tiba-tiba ada kabar bahwa Kiai Miftah diopname di RSI Kalianget dan hari berikutnya tersebar berita bahwa Beliau telah wafat. Oleh karena itu, berita meninggalnya Kiai yang merupakan keturunan pertama dari pendiri Pesantren Al-Munawarah, KH Zain, cukup memberikan duka yang begitu mendalam.
Salah satu kerabat dekat KH Miftahul Arifin Zain, Kiai Baihaqi Bashir, melalui pesan WA memberitahukan bahwa Beliau wafat di rumahnya, area Pesantren Al-Munawarah, sekitar pukul 20.20 hari Senin malam. Menurut kerabat dekat lainnya, Kiai Miftah meninggal dunia karena penyakit darah tinggi dan infeksi lambung. Penyakit ini yang mengantar Kiai Miftah hingga menghadap kepada Allah swt. Kiai Miftah juga sebagai alumni dari Pesantren Annuqayah, Guluk-Guluk, Sumenep, Jawa Timur.