Namun demikian, khusus santri yang masih di pondok, setiap kali akan mengikuti pengajian kitab kuning atau kegiatan lain harus menerapkan protokol kesehatan. Misalnya, dilakukan pengecekan suhu badan dan menerapkan peraturan physical distancing atau jaga jarak di lingkungan pondok.
Di Pondok Pesantren Asshodiqiyah Semarang ini, pengajian kitab kuning dilakukan setidaknya lima kali dalam sehari. Yang pertama biasanya dimulai pukul 10.00 pagi. Sesi pertama ini berakhir saat waktu salah dhuhur. Sehabis dhuhur, sekitar pukul 13.00 dilaksanakan pengajian kitab kuning sesi kedua, yang berakhir pada saat salat ashar. Setelah itu, sekitar pukul 15.00, dilanjutkan sesi ketiga. Sehabis berbuka, ngaji lagi sampai isya. Sehabis salat tarawih pukul 21.00, dilaksanakan sesi terakhir ngaji kitab kuning.

